第二進是整體「五進十一開間」格局中的第二道院落，位於第一進之後、第三進之前。
第一進與第二進的門廳部分是由林朝棟在清同治九年（1870年）至光緒九年（1883年）期間增建而成。
第二進亦被稱為「轎廳」的一部分，其牆面仍保存有書畫墨跡，是觀察建築文化與書法藝術的重要空間。
第二進作為建築群的第二層空間，功能較第一進更為內部化。它不像第一進那樣開放迎賓，而更具家族內部使用與禮儀性質。
牆面上保留有多幅珍貴書畫墨跡，如李鴻章的四屏墨跡與吳魯的題字，顯示出當時林家與政壇、文壇之間的深厚交流。
建築格局延續中軸線的對稱設計，左右設有護龍，形成完整的院落空間，展現官宅嚴謹而莊重的層次感。
第二進透過其書畫與空間設計，象徵林家在清代社會中的文化地位與人文修養。牆上的書法不僅是藝術作品，也象徵著林家與高官文人的交誼。